Dentro del equipo, el cargo con mayor responsabilidad es la dirección deportiva, el cual le corresponde a Ralf Rangnick, exentrenador del Schalke 04 alemán, llegando al club salzburgués por mandato de Red Bull en 2012. Rangnick también se ocupa desde 2012 de la dirección deportiva del R. B. Leipzig en Alemania. El Red Bull Salzburg forma parte de una organización que agrupa todos los equipos de fútbol controlados por la empresa: RasenBallsport Leipzig (Alemania), camisetas barça New York Red Bulls (Estados Unidos) y Red Bull Bragantino (Brasil).